結構不同，類別不同。
1、結構不同。膦酸鹽含磷氧鍵和磷磷鍵，磷酸酯只含有磷氧鍵。
2、類別不同。磷酸鹽是磷元素的自然形態，是一種天然成分，對生物很重要，且主要用于食品工業中，磷酸酯是磷酸的酯衍生物，屬于磷酸衍生物的一類。